Votre employeur ne peut vous décompter le dimanche en repos hebdomadaire dans la mesure où il s'agit pour vous d'un jour habituellement travaillé. Il doit remplacer le dimanche par un autre jour, qui pourra être dans votre cas le vendredi. Il ne peut vous déduire 13 jours de CP. Il doit vous déduire 12 jours.

Le droit aux congés payés ainsi que leur décompte s'effectue en jours ouvrables. Sont considérés comme jours ouvrables tous les jours qui ne sont pas consacrés au repos hebdomadaire légal, reconnus fériés par la loi ou habituellement chômés dans l'établissement.
Par jour ouvrable, il faut comprendre chaque jour de la semaine, du lundi au samedi inclus, sauf le dimanche (ou le jour de repos hebdomadaire qui le remplace dans la semaine, selon les établissements) et les jours fériés chômés. Peu importe que le salarié ait deux jours de repos hebdomadaire dans la semaine, on lui décompte 6 jours ouvrables de congés payés.

Cette définition du jour ouvrable ne signifie pas forcément jour travaillé, ce qui oblige à compter au même titre que les autres jours de la semaine les samedis compris dans une période de congé, qu'ils soient ou non chômés dans l'entreprise.

Lorsque le premier jour de congé tombe un samedi, il n'a pas à être comptabilisé. Le point de départ du congé est toujours un jour ouvré (travaillé) dans l'entreprise. En revanche, si le dernier jour de congé tombe un jour ouvrable, non travaillé dans l'entreprise, le congé n'est pas prolongé d'une journée. (Cass. soc. 7 avril 2004).
Ainsi, sauf si le premier jour de congé est un jour ouvrable non travaillé, tous les autres samedis ou lundis de congés, dont les derniers du congé, comptent.

Exemple : Une entreprise travaille sur la base de 5 jours par semaine avec 2 jours de repos, le samedi et le dimanche. Quand un salarié demande un jour de congé le vendredi, c'est 2 jours ouvrables de congés payés qui doivent être décomptés. En effet, dans ce cas, le samedi est pris en compte car il suit un jour de congé. En revanche, si le salarié veut prendre un lundi pour avoir un week-end de 3 jours, il ne lui sera décompté qu'un jour ouvrable de congés payés, car le dimanche n'est pas un jour ouvrable.

Vous partez en congé un samedi qui est un jour habituellement travaillé, donc on le décompte en CP. J'ai pris le vendredi qui remplace le dimanche dans la mesure où vous travaillez le dimanche et que votre entreprise n'a pas de jours de fermeture. On décompte donc 6 jours ouvrables de CP par semaine, et le décompte s'arrête au jeudi 9 décembre, le vendredi 10 est considérée comme votre jour de repos hebdomadaire, puis vous reprenez le travail le samedi 11 décembre.

Vous avez tout à fait le droit. Le décompte des congés payés commence le premier jour travaillé, et votre employeur ne peut décider de vous supprimer un jour de repos hebdomadaire juste avant vos congés payés. Je vous précise que vous avez trois ans pour réclamer des arriérés de salaire.