Vous ne pouvez pas annualiser les heures d'un apprenti y compris d'un apprenti majeur. En effet, l'article 1 définissant le champ d'application de l'avenant n°19 relatif à l'aménagement du temps de travail sur une période supérieure à la semaine et au plus égale à l'année prévoit que l'accord s'applique à l'ensemble des salariés embauchés à temps plein, y compris les salariés en CDD, à l'exclusion des salariés embauchés sous contrat de formation en alternance. Ce qui veut dire que vous ne pouvez appliquer cet aménagement du temps de travail ni aux apprentis ni aux salariés en contrat de professionnalisation.
Pour rappel : l'annualisation a été remplacé par la modulation du temps de travail, qui a été elle-même remplacé par l'aménagement du temps de travail sur une période supérieure et au plus égale à l'année.