Oui, le règlement peut être modifié par l’employeur.
Dans ce cas, toute modification devra respecter la procédure applicable à l’élaboration du règlement intérieur, à savoir : consultation obligatoire des membres du CSE, communication à l’inspecteur du travail, dépôt au conseil des prud’hommes et publicité par tout moyen via affichage par exemple.
Le non-respect de ces formalités rend le règlement intérieur inopposable aux salariés.
En clair, il est un peu tard pour modifier le règlement intérieur. Mais dans le contexte actuel, il faut être souple sur les règles. Votre employeur essayant d'adapter les règles à l'activité qui reprends doucement et de façon incertaine.