Selon la FAQ réalisé par l'Urssaf sur la prime d'inflation, cette prime doit être aussi versée aux salariés qui sont absents au mois d'octobre s'ils remplissent les autres conditions.

A.11 Un salarié absent au mois d’octobre (période de référence) peut-il bénéficier du versement de l’indemnité ?
Oui. Il n’est pas tenu compte de la présence ou de l’absence effective au cours de la période de référence pour calculer l’indemnité. Elle est versée même aux salaries absents pour congés (à l’exception des salariés en congés parental d’éducation à temps complet : dans ce cas, le versement de l’indemnité n’est pas réalisé par l’employeur), pour cause de maladie ou autres, qu’ils perçoivent ou non une rémunération en octobre, dès lors que les autres critères sont satisfaits.