Vous ne serez pas en situation de congés payés proprement dit car votre contrat sera terminé, mais vous toucherez votre indemnité de congés payés qui vous permettra de partir en vacances.

Selon les jurisprudences européenne et française, le salarié tombe malade avant son départ en vacances bénéficie de ses congés à son retour. En effet, le salarié malade avant ses congés est considéré comme en arrêt maladie et non en congés payés. Il bénéficie ainsi du maintien de sa rémunération par l’employeur (90% du salaire brut déduction faites des indemnités journalières à partir du 8ème jour d’arrêt et pendant une période de 30 jours puis à 66,66% pendant une autre période de 30 jours à condition d’avoir un an d’ancienneté. En précisant que ces périodes sont rallongées selon l’ancienneté du salarié).
L’employeur doit verser l’indemnité de congés payés au salarié lorsqu'il prendra ses jours de congés reportés, après la fin de son arrêt maladie.
Mais si le contrat de travail du salarié est rompu avant qu'il n'ait pu bénéficier du report de ses congés, le salarié a droit à une indemnité compensatrice de congés payés (Cass.soc. 24 février 2009, n°07-43479).
Par conséquent, dans votre cas, vous bénéficierez de l’indemnisation maladie pendant vos congés payés. Puis vous bénéficierez ensuite d’une indemnité de congés payés.

Comme je vous l'ai écrit plus haut : L’employeur doit verser l’indemnité de congés payés au salarié lorsqu'il prendra ses jours de congés reportés, après la fin de son arrêt maladie.
Dans votre cas, si j'ai bien compris vous souhaitez mettre fin à votre contrat de travail et ne pas revenir, par conséquent vos congés ne seront pas reportés, mais vous bénéficiez d'une indemnité compensatrice de congés payés.